Virus Shamonda : premier cas humain en France — ce que l’on sait de cette maladie du bétail transmise par les culicoïdes

Ce qui s’est passé

Le 22 octobre 2026, les ministères français de la Santé et de l’Agriculture ont publié un communiqué commun : pour la première fois au monde, une infection humaine par le virus Shamonda a été identifiée. Un patient au système immunitaire très affaibli était soigné à Lyon pour une maladie grave et est décédé début octobre. Selon les premiers éléments, les complications neurologiques qu’il a présentées sont très probablement liées à ce virus.

Les médecins ont signalé la suspicion d’infection aux autorités sanitaires le 7 octobre, et le virus a été retrouvé dans plusieurs prélèvements du patient. Le 23 octobre, Santé publique France a donné des précisions. La France a notifié le cas à l’Organisation mondiale de la santé et au Centre européen de prévention et de contrôle des maladies. Les autorités ne communiquent ni l’âge du patient ni d’autres informations le concernant. L’enquête se poursuit.

Comment l’infection s’est probablement produite

Le Shamonda n’est pas un virus qui se transmet d’homme à homme ni par l’alimentation. Chez les animaux, il est transmis par les culicoïdes — de minuscules moucherons piqueurs qui se nourrissent de sang. Les spécialistes estiment que le patient a très probablement été infecté par une piqûre de culicoïde dans l’est de la France, où le virus a circulé chez les animaux au printemps et en été. Aucune transmission interhumaine n’a été constatée.

Selon les autorités, l’état du patient a joué un rôle déterminant : en raison d’une immunodépression sévère, son organisme n’a pas pu venir à bout d’une infection qu’une personne en bonne santé n’aurait probablement même pas remarquée.

Ce que disent les autorités

À ce stade, aucun risque pour la santé de la population n’a été identifié. Il s’agit d’un cas exceptionnel chez un patient sévèrement immunodéprimé.

Ministères de la Santé et de l’Agriculture, communiqué commun du 22 octobre 2026

Les ministères soulignent que le virus a circulé pendant des décennies chez les animaux en Afrique et en Asie sans jamais avoir été détecté chez l’homme.

De quel virus s’agit-il

Le virus Shamonda est un orthobunyavirus et appartient au même groupe que le virus de Schmallenberg. Les Européens se souviennent bien de Schmallenberg : en 2011, il est apparu soudainement en Allemagne et aux Pays-Bas et, en deux ans, s’est répandu dans toute l’Europe en provoquant des malformations chez les veaux et les agneaux. Il doit son nom à la petite ville de Schmallenberg, en Rhénanie-du-Nord-Westphalie, où il a été découvert chez des vaches présentant de la fièvre et une baisse de production laitière. Au cours de l’hiver 2011–2012, les éleveurs de toute l’Europe ont vu naître des veaux et des agneaux aux membres déformés et aux malformations cérébrales — on a alors compris à quel point le virus était dangereux pour les femelles gestantes.

Le Shamonda a été isolé pour la première fois chez des bovins au Nigeria en 1965. Depuis, on l’a retrouvé chez des vaches dans plusieurs pays d’Afrique ainsi qu’en Asie, notamment au Japon. Le 22 octobre, l’Organisation mondiale de la santé animale (OMSA) a publié une synthèse sur les effets du virus chez les animaux et noté que l’impact complet des variants qui circulent en Europe n’est pas encore connu.

Comment le virus est arrivé en Europe

En Europe, le virus Shamonda a été détecté pour la première fois fin juillet 2026, notamment dans des élevages bovins en France. Selon le bulletin de l’institut national français de santé animale, il a désormais été identifié dans 14 pays d’Europe de l’Ouest — parmi lesquels l’Allemagne, l’Autriche, la Suisse, les Pays-Bas, la Belgique, l’Italie et le Luxembourg. Le 23 octobre, la République tchèque a elle aussi annoncé un premier cas : le virus a été trouvé chez un fœtus avorté dans un élevage bovin de Bohême du Sud.

On ne sait pas encore exactement comment le virus est arrivé en Europe. Les culicoïdes peuvent être transportés par le vent sur de longues distances, et les virus qu’ils transmettent se propagent avec le bétail et les insectes.

Le virus Shamonda ne figure pour l’instant ni sur les listes nationales de maladies réglementées ni sur la liste de l’UE. Sa détection n’entraîne donc pas de mesures d’urgence comme l’abattage ou des zones réglementées, et il n’a pas d’incidence sur les certificats vétérinaires d’exportation des animaux. Les pays se limitent à la surveillance : la République tchèque, par exemple, analyse depuis le 1er octobre, aux frais de l’État, les fœtus avortés, les veaux malformés, mort-nés ou non viables.

En quoi le virus est dangereux pour les animaux

Les principaux hôtes du virus sont les bovins. Selon l’OMSA, les chevaux, les alpagas, les moutons et les chèvres peuvent aussi être infectés.

• Bovins. Diarrhée aiguë, fièvre, abattement et forte chute de la production laitière. Dans une étude portant sur neuf élevages laitiers en France, la production a baissé jusqu’à 75% dans les troupeaux infectés. Chez les vaches gestantes, le virus peut provoquer des avortements et des malformations chez les veaux.
• Chevaux. Le service vétérinaire tchèque décrit chez les chevaux des inflammations du cerveau et des troubles nerveux. En été, des infections isolées ont été trouvées en France chez des chevaux et des petits ruminants.
• Moutons, chèvres, alpagas sont également sensibles, mais on dispose encore de peu de données sur l’évolution de la maladie chez eux.

Il n’existe pas de vaccin commercial contre le virus Shamonda.

Que sont les culicoïdes

Les culicoïdes du genre Culicoides sont de très petits moucherons de 1 à 3 millimètres, plus petits qu’un moustique. Ils sont actifs au crépuscule et à l’aube, par temps chaud et sans vent, et se reproduisent dans les sols humides, le fumier et près des points d’eau. Les culicoïdes transmettent plusieurs maladies animales importantes — par exemple la fièvre catarrhale ovine et le virus de Schmallenberg. En Europe de l’Ouest, ils sont actifs du printemps à la fin de l’automne ; l’hiver, par temps froid, leur activité s’arrête presque. Le vent peut les transporter sur des dizaines, voire des centaines de kilomètres — c’est ainsi que la fièvre catarrhale ovine a franchi mers et frontières les années précédentes.

Faut-il s’inquiéter pour l’homme ?

Pour la grande majorité des gens, selon les autorités, il n’y a aucun risque. Rien n’indique que le virus se transmette d’homme à homme, par les aliments ou par contact avec les animaux. La viande et le lait des élevages où le virus a été trouvé ne présentent pas de danger : seule la piqûre des culicoïdes transmet la maladie.

Les personnes très immunodéprimées doivent être plus prudentes — par exemple après une greffe, sous chimiothérapie ou sous traitement immunosuppresseur. Il leur est utile d’évoquer avec leur médecin la protection contre les piqûres d’insectes, surtout si elles vivent à la campagne près d’élevages.

Pour les scientifiques, ce cas n’est pas totalement inattendu. Le même groupe de virus comprend le virus Oropouche, lui aussi transmis par les culicoïdes : en Amérique du Sud et centrale, il provoque depuis longtemps chez l’homme une fièvre avec maux de tête et douleurs musculaires ; une importante épidémie y a eu lieu en 2024, et plusieurs cas ont été importés en Europe par des voyageurs. Les spécialistes français étudient donc attentivement si le Shamonda peut infecter l’homme plus souvent qu’on ne le pensait.

Comment se protéger des piqûres de culicoïdes

• Utilisez des répulsifs cutanés, surtout le soir et tôt le matin.
• Au crépuscule, portez des manches longues et un pantalon si vous êtes près d’élevages, de pâtures ou de points d’eau.
• Les moustiquaires ordinaires n’arrêtent pas les culicoïdes — il faut une maille plus fine.
• Les culicoïdes volent mal par vent, un ventilateur aide donc à l’intérieur.

Ce que doivent faire les propriétaires de chevaux et les éleveurs

• Voyez avec votre vétérinaire quels répulsifs et insecticides sont autorisés pour vos animaux.
• Pendant la saison des culicoïdes, il est utile de rentrer les chevaux au box au crépuscule et à l’aube et d’utiliser couvertures et masques anti-mouches.
• Évacuez le fumier et évitez l’eau stagnante près des boxes et des paddocks.
• Planifiez l’insémination des vaches pour que la période sensible de la gestation — environ de la 8e à la 14e semaine — ne coïncide pas avec la saison des culicoïdes.
• En cas de fièvre, de chute de la production laitière, d’avortements ou de signes nerveux, appelez le vétérinaire : seule une analyse dira s’il s’agit du Shamonda, de la fièvre catarrhale ou d’une autre maladie.

Et les chiens et les chats ?

Aucune donnée n’indique que le virus Shamonda rende malades les chiens et les chats. Les culicoïdes piquent aussi les animaux de compagnie, mais pour eux la principale protection contre les insectes reste les antiparasitaires habituels contre puces, tiques et moustiques, choisis avec le vétérinaire. Aucune mesure particulière n’est nécessaire pour l’instant pour les propriétaires de chiens et de chats. Si vous habitez près d’un élevage où le virus a été trouvé, promenez votre chien comme d’habitude ; il est seulement raisonnable de ne pas s’attarder au crépuscule près des tas de fumier, des pâtures humides et des eaux stagnantes, où les culicoïdes sont les plus nombreux.

Et ensuite

Les autorités françaises poursuivent l’enquête et la surveillance du virus chez les animaux. Les scientifiques étudient la dangerosité des variants européens pour le bétail et la solidité de leur implantation dans la nature. Avec le froid, l’activité des culicoïdes diminue, mais le virus peut revenir au printemps — comme ce fut le cas avec la fièvre catarrhale ovine et Schmallenberg. Si vous élevez des bovins, des moutons, des chèvres ou des chevaux, suivez les communiqués des services vétérinaires de votre pays. Signalez à votre vétérinaire chaque avortement, ainsi que les veaux, agneaux et chevreaux malformés nés en hiver et au printemps : c’est précisément grâce à ces cas que l’on a compris en 2012 l’ampleur de la propagation de Schmallenberg.